
A,在由染色体上下文分组的热点中的Spo11-Oligo计数的变化。电话,端粒20千克以内;CEN,在±10 kb的中心粒中;rDNA,从60 kb向左到30 kb的rDNA;间隙,其他所有。虚线标记为没有变化和平均变化(1.8倍)。盒子表示中位数和四分位数范围;晶须表示最极端的数据点是盒子中四分位间范围≤1.5倍。各个要点是异常值。亚电体和周围区域平均显示Zip3的增加较少,因此,ZMM依赖性反馈的贡献比其他未知因素降低了这些区域中DSB的未知因素。rDNA附近的区域没有增加甚至减少。因此,ZIP3突变体具有该区域的DSB抑制作用,该抑制作用取决于ATPase PCH2和复制因子ORC1(参考文献54)。请注意,其余的间质热点显示对Zip3突变的响应高度可变(> 20倍)。b,zip3中spo11-oligo计数的对数折叠变化与指示蛋白的结合之间的相关性,在不同大小的非重叠窗口中进行了bin。闭合符号,p <0.05。芯片数据来自参考。38。C,根据Zip3的平均折叠变化,间质热点周围的平均芯片轮廓分为三个相等的组。顶部,盒子和晶须图(如A所述)显示了三组的折叠变化的分布。底部,每个指示的蛋白质的芯片轮廓。请注意,对于REC102和REC104,剖面彼此靠在彼此之间。虚线箭头指示平均轮廓的变化方向,而Zip3的倍数变化增加。芯片数据来自参考文献38和39。D,对于REC114,MEI4和MER2(对于DSB形成至关重要)和HOP1和RED1(促进正常DSB形成)的REC114,MEI4和MER2(MEI4和MER2)的高度分类芯片数据38(对于DSB形成至关重要)。第一个主组件(PC1)捕获了这种芯片数据组合的90%以上的差异。以前描述了这些蛋白质之间的高度相关性38。E,Zip3(Zip3 FC,Log2和假设范围范围1.8倍)的倍数变化与各种染色体特征之间的相关性:REC114,MEI4,MEI4,MER2,HOP1和RED1 CHIP数据的主成分1(与D中相同);染色体大小(LOGE(BP));G+C含量(%);和指示蛋白质的芯片数据(Log2)。在D和E中,右上方面板显示成对的散点图和左下面板显示了相应的相关系数(Pearson's R),用于在35-KB非重叠窗口中固定的间隙区域的数据。基本相同的结果是通过不同的窗口尺寸(20-40 kb)或窗户放置不同的结果(数据未显示)。f,无论考虑在非重叠的35-kb箱(上图)还是间质热点(下面板)(下面板),野生型中的DSB活性与Zip3中的DSB活性之间无关。假定ZIP3中的全基因组增加了1.8倍。注意:折叠更改是根据线性刻度标记的,但在面板A,c,f中以日志刻度绘制。