冠状病毒已成为有史以来第一个被完全数字化的病毒
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我们都讨厌生物学版本和数字版本，尤其是在大流行期间，现在，在全球，第一研究人员将生物病毒变成了一种数字病毒。话虽如此，本着公平的精神，并非所有病毒都不好，其中一些病毒确实有其用途 - 例如变成分子汇编器以制造锂离子和下一代电池。
尽管使电池电池的病毒非常有用，但在当今的Covid-19大流行期间更有用的是能够创建负责Covid-19的整个病毒的计算模型，因为要对其进行数字化和建模，它就是理解它的 - 并帮助开发疫苗以杀死它。此外，芝加哥大学的新模式背后的团队已公开使用，因此任何人都可以使用它来帮助他们对致命病毒的研究。
格雷戈里·沃斯（Gregory Voth）教授说：“如果您能理解病毒的工作原理，那就是停止该病毒的第一步。”“关于病毒的生命周期和成分，您知道的每一件事都是您可以击中它的脆弱点。”
Voth和他的团队借鉴了他们以前的经验，以找到病毒的每个组成部分的最重要特征，并放弃“较不重要”的信息，以制作一个全面但仍可在计算机上运行的计算模型。这项技术称为粗粒，沃斯和他的学生帮助开拓了这一技术。
简化的框架有助于解决健康研究中的关键问题：即使病毒是更简单的生物实体之一，计算建模仍然是一个主要挑战 - 尤其是如果您想对任何病毒与宿主的身体进行建模，这将意味着代表数十亿原子。
Voth说：“您可以尝试运行实际整个病毒的原子级模型，但是在计算上它会立即使您陷入困境。”“您可能能够将其管理足够长的时间，例如建模数百纳秒的运动，但这还不够长，无法找到最有用的信息。”
因此，许多研究人员专注于创建病毒单个蛋白质的模型。但是Voth说，尽管此分段过程有其用途，但它也错过了大图的一部分。
“病毒本身就是整体的事情，”计算科学家和Haig Papazian杰出化学服务教授Voth说。“我认为，您不能假设您可以孤立地看单个部分。病毒不仅仅是其部分的总和。”
Voth说，尽管这是任何人有史以来第一次将他的实验室工作多年来为其他病毒（例如艾滋病毒）建模的整个病毒，而他们所学到的最大的教训之一是，该病毒的多个部分彼此合作。例如，科学家可能会研究一种与病毒表面上尖峰蛋白结合的药物，以防止它们附着在宿主的细胞上。
“您可能想知道的主要事情之一是，您需要为其起作用的每种尖峰蛋白吗？沃斯说。“当您试图创建药物或抗体时，这是一个关键问题，这是通过查看整个病毒最好理解的东西。”
该模型还提供了一个框架，科学家可以在新发现后立即整合有关SARS-COV-2病毒的其他信息。
Voth希望该模型对冠状病毒药物设计有用，并了解可能出现的突变，例如最近在英国发现的突变。
Voth说：“建立整个病毒的多尺度模型并迅速整合所有这些信息是一大步的一步。”“我真的为我的实验室感到骄傲。我们确实在创纪录的时间内做到了这一点，实际上是几个月的。如果这个流行病有任何好处，我希望它能够为我们的工具提供进步，以抗击Covid-19的病毒，例如流感，艾滋病毒，艾滋病毒和未来出现的任何新冠状病毒。”
资料来源：芝加哥大学
