1、选拔制度不一样
妇女联合会主席采用无记名投票方式。妇女代表大会选举执委时，可以采取候选人数多于应选人数的差额直接选举办法进行；也可以采取差额选举办法进行预选，产生候选人人选，然后进行等额正式选举。
妇联主任是妇女代表大会选举出来的代表。
2、职责不一样
妇联主任负责贯彻执行上级妇联组织及同级妇女代表大会决议；指导所辖农村妇代会开展妇女工作；加强与乡镇内单位及其妇女组织的联系与合作；
以及培育以妇女为主体会员的协会、联谊会和农村经济合作组织等基层群众组织，推进乡镇妇女工作的社会化；加强乡镇妇联自身建设，提高乡镇妇联干部的学习能力、创新能力和服务能力。
妇联主席负责妇女代表大会的日常工作，妇女代表大会每三至五年举行一次。
3、领导机构不同
妇联主席的领导机构是妇女代表大会，妇女代表大会闭会期间的领导机构是执行委员会。执行委员会全体会议选举主席一人、副主席若干人。执行委员会全体会议，一般每年举行一次。 妇联和农村妇代会接受同级党组织和上级妇女联合会的领导。
4、级别不同
乡镇街道办及上一级的妇女干部称为妇联主席，村负责计划生育工作和妇女工作的干部称为妇联主任。
扩展资料：
妇联简介：
中华全国妇女联合会是全国各族各界妇女在中国***领导下，为争取进一步解放而联合起来的社会群众团体，具有广泛的代表性、群众性和社会性。
中华全国妇女联合会是中国***和中国政府联系妇女群众的桥梁和纽带，是国家政权的重要社会支柱之一。
成立于1949年3月，原名为“中华全国民主妇女联合会”，1957年改名为“中华人民共和国妇女联合会“，1978年又改名为“中华全国妇女联合会”。它的基本职能是：团结、动员广大妇女参与经济建设和社会发展，代表和维护妇女利益，促进男女平等。
中华全国妇女联合会的任务是：
1、团结、动员妇女投身改革开放和社会主义现代化建设，促进经济发展和社会全面进步；
2、教育、引导广大妇女，增强自尊、自信、自立、自强的精神，全面提高素质，促进妇女人才成长；
3、代表妇女参与国家和社会事务的民主管理、民主监督，参与有关妇女、儿童法律、法规、规章的制定，维护妇女儿童合法权益；
4、为妇女儿服务。加强与社会各界的联系，直辖市和推动社会各界为妇女儿童办实事、办好事。
5、巩固和扩大各族各界妇女的大团结，加强同港澳台地区及华侨妇女的联谊，促进祖国统一大业。积极发展同世界各国妇女的友好交往，增进了解和友谊，维护世界和平。
参考资料：
百度百科-妇女主任参考资料：
百度百科-中华全国妇女联合会参考资料：
人民网-中华全国妇女联合会简介